Tuy nhiên, do sự phát triển không ngừng của nền kinh tế thế giới dẫn đến sự xuất hiện của nhiều ngành nghề kinh tế mới, nên để đảm bảo quyền kinh doanh của các chủ thể, Điều 7 Nghị định 78/2015/NĐ-CP quy định:

“5. Đối với những ngành, nghề kinh doanh không có trong Hệ thống ngành kinh tế của Việt Nam và chưa được quy định tại các văn bản quy phạm pháp luật khác thì cơ quan đăng ký kinh doanh xem xét ghi nhận ngành, nghề kinh doanh này vào Cơ sở dữ liệu quốc gia về đăng ký doanh nghiệp nếu không thuộc ngành, nghề cấm đầu tư kinh doanh, đồng thời thông báo cho Bộ Kế hoạch và Đầu tư (Tổng cục Thống kê) để bổ sung ngành, nghề kinh doanh mới.

6. Trường hợp doanh nghiệp có nhu cầu đăng ký ngành, nghề kinh doanh chi tiết hơn ngành kinh tế cấp bốn thì doanh nghiệp lựa chọn một ngành kinh tế cấp bốn trong Hệ thống ngành kinh tế của Việt Nam, sau đó ghi chi tiết ngành, nghề kinh doanh của doanh nghiệp ngay dưới ngành cấp bốn nhưng phải đảm bảo ngành, nghề kinh doanh chi tiết của doanh nghiệp phù hợp với ngành cấp bốn đã chọn. Trong trường hợp này, ngành, nghề kinh doanh của doanh nghiệp là ngành, nghề kinh doanh chi tiết doanh nghiệp đã ghi”.

Tuy nhiên, quy định trên không chỉ rõ khi doanh nghiệp muốn đăng ký ngành nghề kinh doanh không có trong hệ thống ngành nghề kinh tế Việt Nam thì cơ quan đăng ký kinh doanh xem xét ghi nhận ngành nghề vào Cơ sở dữ liệu quốc gia trước hay thực hiện ghi nhận ngành nghề kinh doanh cho doanh nghiệp trước. Điều này dẫn đến bất lợi cho doanh nghiệp khi muốn đầu tư kinh doanh vào ngành nghề kinh tế mới ở Việt Nam vì không xác định được thời gian cụ thể sẽ được ghi nhận ngành nghề kinh tế mới. Điều này sẽ ảnh hưởng trực tiếp đến hoạt động kinh doanh của đơn vị đó. Do đó, pháp luật nên có quy định cụ thể về trình tự, thời gian ghi nhận ngành nghề kinh tế mới và thực hiện ghi nhận ngành nghề kinh tế cho doanh nghiệp kịp thời để đảm bảo quyền lợi cho họ.

Ngoài ra, về việc áp mã ngành nghề chi tiết, chủ thể đăng ký kinh doanh có thể ghi theo quy định tại Quyết định 337/QĐ-BKH quy định chi tiết về nội dung ngành nghề kinh tế. Trong trường hợp ngành nghề chi tiết không được quy định thì doanh nghiệp mới thực hiện ghi chi tiết ngành nghề kinh doanh của mình phù hợp với ngành nghề kinh tế cấp bốn. Như vậy, quy định tại khoản 6 Điều 7 Nghị định 78/2015/NĐ-CP chưa rõ ràng, nên quy định thành: 
“Trường hợp doanh nghiệp có nhu cầu đăng ký ngành, nghề kinh doanh chi tiết hơn ngành kinh tế cấp bốn mà trong hệ thống ngành kinh tế quốc dân không chi tiết thì…”.

Pháp luật nên điều chỉnh lại các quy định để tạo điều kiện thuận lợi nhất cho doanh nghiệp khi thực hiện quyền tự do kinh doanh của mình.